Поиск клинической литературы

Claude skill, который выполняет поиск клинических доказательств по заданной теме в PubMed, Scholar Gateway и на сайтах национальных клинических руководств — с формированием структурированного резюме доказательной базы и верифицированного списка источников.

Что делает скилл

Укажите клиническую тему, и скилл выполнит следующие шаги:

1. Разбор и планирование — выведет MeSH-термины, определит релевантные органы по разработке руководств
2. Поиск национальных руководств (BTS, NICE, KDIGO, BSH, SIGN и др.) через веб-поиск
3. Поиск опубликованных данных в PubMed (по ключевым словам/MeSH) и Scholar Gateway (семантический поиск)
4. Верификация источников — точечная проверка DOI, соответствие заголовка и PMID, отсутствие сфабрикованных идентификаторов
5. Формирование резюме доказательной базы (.docx) с руководствами, актуальными данными и пробелами в доказательной базе
6. Экспорт источников в виде YAML-реестра, BibTeX (.bib) и списка PMID (.txt) для импорта в Zotero

Выходные файлы

Каждый поиск создаёт пять файлов:

Требования

• Claude Desktop или другой клиент Claude с поддержкой MCP-коннекторов
• Рекомендуемая модель: Claude Opus 4.6 — поиск литературы, оценка доказательств и проверка целостности источников требуют более высоких возможностей рассуждения
• Следующие MCP-коннекторы должны быть включены:
  • PubMed — поиск литературы и метаданных статей
  • Scholar Gateway — семантический поиск по рецензируемой литературе
• pandoc — для конвертации markdown в .docx
• Скилл ориентирован на контекст NHS Великобритании (ссылается на MHRA, NICE TAs, реестры Великобритании)

Опциональные MCP-коннекторы (расширяют охват)

• bioRxiv — поиск препринтов на medRxiv/bioRxiv по быстро развивающимся темам
• Clinical Trials — поиск на ClinicalTrials.gov по текущим и завершённым испытаниям для обогащения раздела «Пробелы в доказательной базе»

Установка

Вариант 1: Установка из репозитория

1. Клонируйте репозиторий: git clone https://github.com/Laszlo75/literature-search.git
2. В Claude Desktop откройте Settings → Skills и укажите путь к папке literature-search

После установки

1. Включите необходимые MCP-коннекторы в Claude Desktop (Settings → Connectors):
   • PubMed — для поиска литературы, метаданных статей и получения полного текста
   • Scholar Gateway — для семантического поиска по рецензируемой литературе
2. Установите pandoc: brew install pandoc (macOS) или sudo apt install pandoc (Linux)

Примеры запросов

• «Найди доказательства по профилактике CMV у реципиентов трансплантатов солидных органов»
• «Что говорит актуальная литература о периоперационной антикоагуляции у пациентов на DOAC?»
• «Поиск литературы по дозированию ритуксимаба при ABO-несовместимой трансплантации почки»

Интеграция с protocol-reviewer

Скилл protocol-reviewer может использовать YAML-реестр источников, сформированный данным скиллом, для рецензирования протоколов. Возможны два варианта:

• Сначала запустить literature-search, затем передать YAML в protocol-reviewer
• Позволить protocol-reviewer автоматически инициировать поиск литературы — достаточно загрузить протокол и запросить рецензию

Связанные скиллы

• protocol-reviewer — рецензирует клинические протоколы на соответствие доказательной базе (использует YAML-реестр данного скилла)

Использование AI и управление (ISO 42001)

Инструмент использует AI-синтез доказательств. Результаты AI носят рекомендательный характер и должны быть критически оценены клиницистом. AI-система — Claude (Anthropic), доступ осуществляется через Claude Desktop с интеграциями PubMed и Scholar Gateway.

Каждое резюме доказательной базы формируется как черновик с пометкой «DRAFT — NOT FOR CLINICAL USE» и оговоркой о прозрачности. Источники извлекаются программно из PubMed и верифицируются по метаданным источника.

Полная политика использования AI приведена в CLAUDE.md.

Фразы-триггеры

Скилл активируется на фразы: «literature search», «search PubMed», «find evidence on», «what does the latest evidence say about», «evidence review», «reference list for» или любой запрос клинических доказательств по конкретной теме.