Scientific Agent Skills

🔔 Claude Scientific Skills теперь называется Scientific Agent Skills. Те же навыки, более широкая совместимость — теперь работает с любым AI-агентом, поддерживающим открытый стандарт Agent Skills, а не только с Claude.

Новинка: K-Dense BYOK — бесплатный AI-сопроводитель учёного с открытым исходным кодом для десктопа, работающий на базе Scientific Agent Skills. Используйте собственные API-ключи, выбирайте из 40+ моделей и получите полноценное исследовательское рабочее пространство с веб-поиском, работой с файлами, 100+ научными базами данных и доступом ко всем 133 навыкам этого репозитория. Данные остаются на вашем компьютере; при необходимости можно масштабироваться до облачных вычислений через Modal для тяжёлых нагрузок. Начать здесь.

Обширная коллекция из 133 готовых к использованию научных и исследовательских навыков (охватывает геномику рака, связывание лекарств с мишенями, молекулярную динамику, RNA velocity, геопространственные науки, прогнозирование временных рядов, 78+ научных баз данных и многое другое) для любого AI-агента, поддерживающего открытый стандарт Agent Skills, созданная компанией K-Dense. Работает с Cursor, Claude Code, Codex и другими. Превратите своего AI-агента в исследовательского ассистента, способного выполнять сложные многошаговые научные рабочие процессы в области биологии, химии, медицины и не только.

Эти навыки позволяют AI-агенту беспрепятственно работать со специализированными научными библиотеками, базами данных и инструментами в нескольких научных областях. Хотя агент может самостоятельно использовать любой Python-пакет или API, явно определённые навыки предоставляют тщательно подобранную документацию и примеры, что делает его значительно более мощным и надёжным для следующих рабочих процессов:

• 🧬 Биоинформатика и геномика — анализ последовательностей, одноклеточный RNA-seq, генные регуляторные сети, аннотация вариантов, филогенетический анализ
• 🧪 Хемоинформатика и разработка лекарств — предсказание молекулярных свойств, виртуальный скрининг, ADMET-анализ, молекулярный докинг, оптимизация лидерных соединений
• 🔬 Протеомика и масс-спектрометрия — обработка LC-MS/MS, идентификация пептидов, спектральное сопоставление, количественное определение белков
• 🏥 Клинические исследования и персонализированная медицина — клинические испытания, фармакогеномика, интерпретация вариантов, безопасность лекарств, поддержка клинических решений, планирование лечения
• 🧠 Healthcare AI и клиническое ML — анализ ЭМК, обработка физиологических сигналов, медицинская визуализация, клинические прогностические модели
• 🖼️ Медицинская визуализация и цифровая патология — обработка DICOM, анализ цельных гистологических срезов, вычислительная патология, радиологические рабочие процессы
• 🤖 Машинное обучение и AI — глубокое обучение, обучение с подкреплением, анализ временных рядов, интерпретируемость моделей, байесовские методы
• 🔮 Материаловедение и химия — анализ кристаллических структур, фазовые диаграммы, метаболическое моделирование, вычислительная химия
• 🌌 Физика и астрономия — анализ астрономических данных, преобразования координат, космологические вычисления, символьная математика, физические расчёты
• ⚙️ Инженерия и симуляция — дискретно-событийное моделирование, многокритериальная оптимизация, метаболическая инженерия, системное моделирование, оптимизация процессов
• 📊 Анализ данных и визуализация — статистический анализ, сетевой анализ, временные ряды, публикационные графики, обработка больших данных, EDA
• 🌍 Геопространственные науки и дистанционное зондирование — обработка спутниковых снимков, GIS-анализ, пространственная статистика, анализ рельефа, ML для наблюдения Земли
• 🧪 Лабораторная автоматизация — протоколы жидкостного дозирования, управление лабораторным оборудованием, автоматизация рабочих процессов, интеграция с LIMS
• 📚 Научная коммуникация — обзор литературы, рецензирование, научное письмо, обработка документов, постеры, слайды, схемы, управление цитированием
• 🔬 Мультиомика и системная биология — интеграция мультимодальных данных, анализ путей, сетевая биология, системный анализ
• 🧬 Инженерия и дизайн белков — языковые модели белков, предсказание структуры, дизайн последовательностей, аннотация функций
• 🎓 Методология исследований — генерация гипотез, научный мозговой штурм, критическое мышление, написание грантов, оценка учёных

Превратите своего AI-агента в «AI-учёного» прямо на вашем рабочем столе!

⭐ Если этот репозиторий оказался полезным, пожалуйста, поставьте звезду! Это помогает другим найти эти инструменты и мотивирует нас продолжать поддерживать и расширять коллекцию.

🎬 Впервые знакомитесь с Scientific Agent Skills? Посмотрите наше видео Getting Started with Scientific Agent Skills для быстрого ознакомления.

📦 Что включено

Репозиторий предоставляет 133 научных и исследовательских навыка, организованных по следующим категориям:

• 100+ научных и финансовых баз данных — единый навык поиска по базам данных обеспечивает прямой доступ к 78 публичным базам данных (PubChem, ChEMBL, UniProt, COSMIC, ClinicalTrials.gov, FRED, USPTO и другим), а также специализированные навыки для DepMap, Imaging Data Commons, PrimeKG и U.S. Treasury Fiscal Data. Мультибазовые пакеты, такие как BioServices (~40 биоинформатических сервисов), BioPython (38 подбаз данных NCBI через Entrez) и gget (20+ геномных баз данных), обеспечивают дополнительное покрытие